index
:
quikr.git
galaxy
master
Quikr - a bio classifier based on NNLS
summary
refs
log
tree
commit
diff
log msg
author
committer
range
path:
root
/
src
/
nbc
Mode
Name
Size
-rw-r--r--
GPL-3
35068
log
plain
-rw-r--r--
LICENSE
661
log
plain
-rw-r--r--
Makefile
343
log
plain
-rw-r--r--
NEWS
218
log
plain
-rw-r--r--
README
107
log
plain
-rw-r--r--
binary.sml
737
log
plain
-rw-r--r--
build.sh
115
log
plain
-rw-r--r--
clean.sh
86
log
plain
-rw-r--r--
count.ml
1862
log
plain
-rw-r--r--
count.mlb
136
log
plain
-rw-r--r--
count.sml
7229
log
plain
-rw-r--r--
fail.sml
190
log
plain
-rw-r--r--
fasta-all.mlb
97
log
plain
-rw-r--r--
fasta-test.mlb
79
log
plain
-rw-r--r--
fasta.mlb
113
log
plain
-rw-r--r--
fasta.sml
8252
log
plain
-rw-r--r--
gene.mlb
51
log
plain
-rw-r--r--
gene.sml
1125
log
plain
-rw-r--r--
genome.sml
755
log
plain
-rw-r--r--
gzip.c
257
log
plain
-rw-r--r--
gzip.sml
4255
log
plain
-rw-r--r--
history.mlb
54
log
plain
-rw-r--r--
history.sml
1561
log
plain
-rw-r--r--
judy.sml
4624
log
plain
-rw-r--r--
kahan.sml
616
log
plain
-rw-r--r--
main.sml
2415
log
plain
-rw-r--r--
matlab.sml
3791
log
plain
-rw-r--r--
misc.sml
3253
log
plain
-rw-r--r--
nmer-all.mlb
69
log
plain
-rw-r--r--
nmer-test.mlb
78
log
plain
-rw-r--r--
nmer.mlb
79
log
plain
-rw-r--r--
nmer.sml
12670
log
plain
-rw-r--r--
options.sml
5880
log
plain
-rw-r--r--
parse-state.mlb
58
log
plain
-rw-r--r--
parse-state.sml
2371
log
plain
-rw-r--r--
probabilities-by-read.mlb
130
log
plain
-rw-r--r--
probabilities-by-read.sml
4720
log
plain
-rw-r--r--
program.sml
176
log
plain
-rw-r--r--
promise.mlb
54
log
plain
-rw-r--r--
promise.sml
937
log
plain
-rw-r--r--
score.mlb
422
log
plain
-rw-r--r--
score.sml
962
log
plain
-rw-r--r--
sequence.sml
1278
log
plain
-rw-r--r--
stopwatch.sml
531
log
plain
-rw-r--r--
storejudy.sml
334
log
plain
-rw-r--r--
stream.mlb
66
log
plain
-rw-r--r--
stream.sml
7589
log
plain
-rw-r--r--
substitution.grm
1199
log
plain
-rw-r--r--
substitution.lex
1671
log
plain
-rw-r--r--
substitution.sml
813
log
plain
-rw-r--r--
tabulate.ml
5154
log
plain
-rw-r--r--
test-generate.sml
25
log
plain
-rw-r--r--
test-library.mlb
59
log
plain
-rw-r--r--
test-library.sml
955
log
plain
-rw-r--r--
tree.mlb
63
log
plain
-rw-r--r--
tree.sml
5339
log
plain