From 1e02d01f14a71c33fe150e8bfbac9ebff5dd6b62 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Calvin Date: Tue, 28 May 2013 11:54:22 -0400 Subject: modified quikrTrain.m to not depend on a mer file, instead use the generate_kmers --- src/matlab/6mers.txt | 4096 -------------------------------------------------- 1 file changed, 4096 deletions(-) delete mode 100644 src/matlab/6mers.txt (limited to 'src/matlab/6mers.txt') diff --git a/src/matlab/6mers.txt b/src/matlab/6mers.txt deleted file mode 100644 index f9e0086..0000000 --- a/src/matlab/6mers.txt +++ /dev/null @@ -1,4096 +0,0 @@ -aaaaaa -aaaaac -aaaaag -aaaaat -aaaaca -aaaacc -aaaacg -aaaact -aaaaga -aaaagc -aaaagg -aaaagt -aaaata -aaaatc -aaaatg -aaaatt -aaacaa -aaacac -aaacag -aaacat -aaacca -aaaccc -aaaccg -aaacct -aaacga -aaacgc -aaacgg -aaacgt -aaacta -aaactc -aaactg -aaactt -aaagaa -aaagac -aaagag -aaagat -aaagca -aaagcc -aaagcg -aaagct -aaagga -aaaggc -aaaggg -aaaggt -aaagta -aaagtc -aaagtg -aaagtt -aaataa -aaatac -aaatag -aaatat -aaatca 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-gagaag -gagaat -gagaca -gagacc -gagacg -gagact -gagaga -gagagc -gagagg -gagagt -gagata -gagatc -gagatg -gagatt -gagcaa -gagcac -gagcag -gagcat -gagcca -gagccc -gagccg -gagcct -gagcga -gagcgc -gagcgg -gagcgt -gagcta -gagctc -gagctg -gagctt -gaggaa -gaggac -gaggag -gaggat -gaggca -gaggcc -gaggcg -gaggct -gaggga -gagggc -gagggg -gagggt -gaggta -gaggtc -gaggtg -gaggtt -gagtaa -gagtac -gagtag -gagtat -gagtca -gagtcc -gagtcg -gagtct -gagtga -gagtgc -gagtgg -gagtgt -gagtta -gagttc -gagttg -gagttt -gataaa -gataac -gataag -gataat -gataca -gatacc -gatacg -gatact -gataga -gatagc -gatagg -gatagt -gatata -gatatc -gatatg -gatatt -gatcaa -gatcac -gatcag -gatcat -gatcca -gatccc -gatccg -gatcct -gatcga -gatcgc -gatcgg -gatcgt -gatcta -gatctc -gatctg -gatctt -gatgaa -gatgac -gatgag -gatgat -gatgca -gatgcc -gatgcg -gatgct -gatgga -gatggc -gatggg -gatggt -gatgta -gatgtc -gatgtg -gatgtt -gattaa -gattac -gattag -gattat -gattca -gattcc -gattcg -gattct -gattga -gattgc -gattgg -gattgt -gattta -gatttc -gatttg 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